Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnhQ61458 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CcnhQ61458 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcnhQ61458 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CcnhQ61458 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CcnhQ61458 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CcnhQ61458 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnhQ61458 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnhQ61458 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnhQ61458 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnhQ61458 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcnhQ61458 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms