Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hif1aQ61221 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hif1aQ61221 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hif1aQ61221 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hif1aQ61221 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hif1aQ61221 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hif1aQ61221 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hif1aQ61221 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hif1aQ61221 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hif1aQ61221 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms