Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nab1Q61122 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nab1Q61122 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nab1Q61122 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms