Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep250Q60952 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep250Q60952 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep250Q60952 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep250Q60952 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep250Q60952 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cep250Q60952 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cep250Q60952 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms