Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Neurod1Q60867 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Neurod1Q60867 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Neurod1Q60867 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Neurod1Q60867 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms