Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NfkbibQ60778 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NfkbibQ60778 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfkbibQ60778 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NfkbibQ60778 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms