Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rabl6Q5U3K5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rabl6Q5U3K5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rabl6Q5U3K5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms