Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SynrgQ5SV85 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SynrgQ5SV85 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SynrgQ5SV85 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SynrgQ5SV85 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SynrgQ5SV85 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms