Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf215Q5SPX3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf215Q5SPX3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf215Q5SPX3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms