Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.8 ms