Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kctd1Q5M956 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kctd1Q5M956 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Kctd1Q5M956 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kctd1Q5M956 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms