Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ecm2Q5FW85 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ecm2Q5FW85 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ecm2Q5FW85 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ecm2Q5FW85 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ecm2Q5FW85 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
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