Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox3aQ4TU90 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox3aQ4TU90 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox3aQ4TU90 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3aQ4TU90 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3aQ4TU90 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3aQ4TU90 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3aQ4TU90 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3aQ4TU90 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3aQ4TU90 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox3aQ4TU90 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhox3aQ4TU90 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox3aQ4TU90 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms