Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E130208F15RikQ3UPV3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms