Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ceacam12Q3UKP4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ceacam12Q3UKP4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ceacam12Q3UKP4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ceacam12Q3UKP4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms