Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sf3b2Q3UJB0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sf3b2Q3UJB0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sf3b2Q3UJB0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sf3b2Q3UJB0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sf3b2Q3UJB0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms