Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndst1Q3UHN9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndst1Q3UHN9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndst1Q3UHN9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndst1Q3UHN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms