Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc58Q3UGP9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc58Q3UGP9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc58Q3UGP9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms