Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kdm4dQ3U2K5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kdm4dQ3U2K5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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