Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc9Q3U0M1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc9Q3U0M1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc9Q3U0M1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc9Q3U0M1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms