Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2afvQ3THW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2afvQ3THW5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2afvQ3THW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2afvQ3THW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afvQ3THW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms