Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chrna5Q2MKA5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chrna5Q2MKA5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrna5Q2MKA5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna5Q2MKA5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chrna5Q2MKA5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna5Q2MKA5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna5Q2MKA5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna5Q2MKA5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna5Q2MKA5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna5Q2MKA5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna5Q2MKA5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna5Q2MKA5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms