Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttc39dQ0VF76 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc39dQ0VF76 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc39dQ0VF76 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc39dQ0VF76 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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