Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb8Q0VBD0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Itgb8Q0VBD0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms