Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tff1Q08423 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tff1Q08423 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff1Q08423 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff1Q08423 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff1Q08423 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff1Q08423 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tff1Q08423 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff1Q08423 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff1Q08423 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tff1Q08423 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms