Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cab39Q06138 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cab39Q06138 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cab39Q06138 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.9 ms