Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col9a1Q05722 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col9a1Q05722 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms