Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nf1Q04690 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nf1Q04690 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nf1Q04690 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nf1Q04690 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms