Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnb1Q03717 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnb1Q03717 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms