Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cacna1sQ02789 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacna1sQ02789 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cacna1sQ02789 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacna1sQ02789 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cacna1sQ02789 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms