Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhlh1Q02576 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhlh1Q02576 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nhlh1Q02576 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nhlh1Q02576 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nhlh1Q02576 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms