Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VcpQ01853 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VcpQ01853 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VcpQ01853 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VcpQ01853 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VcpQ01853 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VcpQ01853 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VcpQ01853 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VcpQ01853 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VcpQ01853 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VcpQ01853 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VcpQ01853 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VcpQ01853 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VcpQ01853 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms