Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmb4P99026 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmb4P99026 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb4P99026 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms