Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brca2P97929 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca2P97929 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brca2P97929 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca2P97929 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brca2P97929 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brca2P97929 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brca2P97929 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brca2P97929 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brca2P97929 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brca2P97929 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brca2P97929 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms