Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad4P97471 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad4P97471 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad4P97471 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad4P97471 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad4P97471 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smad4P97471 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad4P97471 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smad4P97471 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad4P97471 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad4P97471 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad4P97471 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad4P97471 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad4P97471 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smad4P97471 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad4P97471 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad4P97471 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms