Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vgll3P85442 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vgll3P85442 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms