Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msx3P70354 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msx3P70354 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx3P70354 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msx3P70354 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msx3P70354 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Msx3P70354 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx3P70354 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msx3P70354 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msx3P70354 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msx3P70354 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msx3P70354 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msx3P70354 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msx3P70354 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msx3P70354 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msx3P70354 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msx3P70354 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msx3P70354 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms