Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps27aP62983 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rps27aP62983 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps27aP62983 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps27aP62983 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms