Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl23aP62751 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl23aP62751 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl23aP62751 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms