Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lsm5P62322 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lsm5P62322 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms