Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp46P62069 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp46P62069 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp46P62069 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp46P62069 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp46P62069 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp46P62069 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp46P62069 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp46P62069 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp46P62069 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp46P62069 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp46P62069 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp46P62069 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp46P62069 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms