Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Actr1aP61164 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actr1aP61164 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actr1aP61164 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Actr1aP61164 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Actr1aP61164 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Actr1aP61164 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Actr1aP61164 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Actr1aP61164 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actr1aP61164 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Actr1aP61164 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Actr1aP61164 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms