Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snap25P60879 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snap25P60879 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap25P60879 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap25P60879 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap25P60879 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snap25P60879 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap25P60879 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap25P60879 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snap25P60879 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snap25P60879 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snap25P60879 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snap25P60879 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snap25P60879 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms