Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3bP59470 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr3bP59470 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr3bP59470 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms