Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scarf2P59222 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scarf2P59222 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Scarf2P59222 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scarf2P59222 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms