Protein–RNA interactions for Protein: P54818

Galc, Galactocerebrosidase, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GalcP54818 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GalcP54818 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GalcP54818 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GalcP54818 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GalcP54818 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GalcP54818 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GalcP54818 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GalcP54818 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GalcP54818 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GalcP54818 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GalcP54818 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GalcP54818 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GalcP54818 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GalcP54818 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GalcP54818 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GalcP54818 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GalcP54818 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GalcP54818 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GalcP54818 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GalcP54818 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GalcP54818 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GalcP54818 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GalcP54818 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GalcP54818 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GalcP54818 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GalcP54818 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GalcP54818 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GalcP54818 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GalcP54818 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GalcP54818 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GalcP54818 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GalcP54818 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GalcP54818 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GalcP54818 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GalcP54818 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GalcP54818 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GalcP54818 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GalcP54818 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GalcP54818 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GalcP54818 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GalcP54818 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GalcP54818 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GalcP54818 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GalcP54818 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GalcP54818 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GalcP54818 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GalcP54818 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GalcP54818 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GalcP54818 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GalcP54818 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GalcP54818 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GalcP54818 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GalcP54818 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GalcP54818 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GalcP54818 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GalcP54818 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GalcP54818 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GalcP54818 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GalcP54818 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GalcP54818 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GalcP54818 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GalcP54818 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GalcP54818 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GalcP54818 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GalcP54818 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GalcP54818 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GalcP54818 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GalcP54818 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GalcP54818 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GalcP54818 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GalcP54818 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GalcP54818 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GalcP54818 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GalcP54818 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GalcP54818 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GalcP54818 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GalcP54818 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GalcP54818 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GalcP54818 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GalcP54818 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GalcP54818 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GalcP54818 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GalcP54818 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GalcP54818 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GalcP54818 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GalcP54818 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GalcP54818 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GalcP54818 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GalcP54818 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GalcP54818 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GalcP54818 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GalcP54818 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GalcP54818 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GalcP54818 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GalcP54818 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GalcP54818 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GalcP54818 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GalcP54818 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GalcP54818 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GalcP54818 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms