Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Msh6P54276 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Msh6P54276 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Msh6P54276 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Msh6P54276 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Msh6P54276 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Msh6P54276 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Msh6P54276 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msh6P54276 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msh6P54276 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Msh6P54276 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Msh6P54276 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msh6P54276 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Msh6P54276 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Msh6P54276 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Msh6P54276 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Msh6P54276 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms