Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FmodP50608 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FmodP50608 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FmodP50608 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FmodP50608 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FmodP50608 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FmodP50608 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FmodP50608 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FmodP50608 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FmodP50608 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FmodP50608 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FmodP50608 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FmodP50608 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FmodP50608 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FmodP50608 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FmodP50608 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FmodP50608 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FmodP50608 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FmodP50608 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FmodP50608 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FmodP50608 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FmodP50608 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FmodP50608 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FmodP50608 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FmodP50608 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FmodP50608 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FmodP50608 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FmodP50608 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FmodP50608 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FmodP50608 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FmodP50608 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FmodP50608 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FmodP50608 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FmodP50608 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FmodP50608 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FmodP50608 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FmodP50608 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FmodP50608 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FmodP50608 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FmodP50608 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FmodP50608 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FmodP50608 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FmodP50608 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FmodP50608 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FmodP50608 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FmodP50608 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FmodP50608 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FmodP50608 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FmodP50608 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FmodP50608 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FmodP50608 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FmodP50608 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FmodP50608 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FmodP50608 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FmodP50608 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FmodP50608 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FmodP50608 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FmodP50608 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FmodP50608 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FmodP50608 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FmodP50608 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FmodP50608 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FmodP50608 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FmodP50608 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FmodP50608 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FmodP50608 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FmodP50608 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FmodP50608 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FmodP50608 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FmodP50608 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FmodP50608 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FmodP50608 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FmodP50608 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FmodP50608 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FmodP50608 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FmodP50608 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FmodP50608 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FmodP50608 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FmodP50608 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FmodP50608 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FmodP50608 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FmodP50608 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FmodP50608 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FmodP50608 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FmodP50608 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FmodP50608 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FmodP50608 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FmodP50608 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FmodP50608 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FmodP50608 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FmodP50608 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms