Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx1P48377 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx1P48377 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx1P48377 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx1P48377 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rfx1P48377 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx1P48377 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx1P48377 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx1P48377 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rfx1P48377 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rfx1P48377 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rfx1P48377 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rfx1P48377 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms