Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gli1P47806 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli1P47806 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gli1P47806 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli1P47806 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gli1P47806 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli1P47806 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli1P47806 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli1P47806 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gli1P47806 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gli1P47806 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli1P47806 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli1P47806 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gli1P47806 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gli1P47806 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gli1P47806 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli1P47806 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli1P47806 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli1P47806 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli1P47806 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli1P47806 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli1P47806 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli1P47806 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli1P47806 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli1P47806 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gli1P47806 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli1P47806 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gli1P47806 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli1P47806 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gli1P47806 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli1P47806 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli1P47806 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli1P47806 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli1P47806 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli1P47806 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli1P47806 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli1P47806 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli1P47806 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gli1P47806 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli1P47806 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli1P47806 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms